Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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