Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYF6P23409 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYF6P23409 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYF6P23409 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms