Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XPAP23025 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XPAP23025 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XPAP23025 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XPAP23025 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XPAP23025 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XPAP23025 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XPAP23025 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XPAP23025 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XPAP23025 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms