Protein–RNA interactions for Protein: P22001

KCNA3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA3P22001 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNA3P22001 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA3P22001 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms