Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT1P21579 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT1P21579 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT1P21579 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT1P21579 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT1P21579 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT1P21579 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT1P21579 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT1P21579 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT1P21579 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT1P21579 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT1P21579 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT1P21579 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT1P21579 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT1P21579 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT1P21579 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT1P21579 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT1P21579 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT1P21579 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYT1P21579 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYT1P21579 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYT1P21579 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYT1P21579 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYT1P21579 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYT1P21579 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYT1P21579 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYT1P21579 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms