Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms