Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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