Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms