Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCAP17252 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms