Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms