Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms