Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CETPP11597 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CETPP11597 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CETPP11597 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CETPP11597 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CETPP11597 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETPP11597 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETPP11597 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETPP11597 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETPP11597 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETPP11597 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETPP11597 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETPP11597 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms