Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ESRRAP11474 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ESRRAP11474 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms