Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRFP10586 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRFP10586 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRFP10586 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRFP10586 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRFP10586 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRFP10586 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRFP10586 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRFP10586 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRFP10586 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRFP10586 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRFP10586 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRFP10586 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRFP10586 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRFP10586 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRFP10586 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRFP10586 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRFP10586 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms