Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI2P10070 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI2P10070 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI2P10070 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI2P10070 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI2P10070 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI2P10070 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI2P10070 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI2P10070 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI2P10070 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI2P10070 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GLI2P10070 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GLI2P10070 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GLI2P10070 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GLI2P10070 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI2P10070 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI2P10070 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI2P10070 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI2P10070 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI2P10070 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI2P10070 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI2P10070 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI2P10070 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI2P10070 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI2P10070 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI2P10070 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI2P10070 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI2P10070 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI2P10070 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI2P10070 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI2P10070 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI2P10070 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI2P10070 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI2P10070 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI2P10070 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI2P10070 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI2P10070 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI2P10070 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI2P10070 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI2P10070 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI2P10070 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI2P10070 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI2P10070 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI2P10070 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI2P10070 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI2P10070 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI2P10070 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI2P10070 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI2P10070 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI2P10070 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI2P10070 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI2P10070 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI2P10070 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI2P10070 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI2P10070 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI2P10070 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI2P10070 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI2P10070 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI2P10070 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI2P10070 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI2P10070 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI2P10070 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI2P10070 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI2P10070 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI2P10070 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI2P10070 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI2P10070 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI2P10070 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI2P10070 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI2P10070 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI2P10070 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI2P10070 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI2P10070 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI2P10070 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI2P10070 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI2P10070 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI2P10070 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI2P10070 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI2P10070 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms