Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms