Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms