Protein–RNA interactions for Protein: P09914

IFIT1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT1P09914 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFIT1P09914 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT1P09914 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms