Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRPRAP08240 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms