Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NGFRP08138 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NGFRP08138 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms