Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBP07199 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBP07199 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBP07199 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms