Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBX7O95931 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms