Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN7O95471 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms