Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHP4O75161 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms