Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms