Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HOXA3O43365 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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HOXA3O43365 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HOXA3O43365 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HOXA3O43365 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HOXA3O43365 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HOXA3O43365 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HOXA3O43365 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HOXA3O43365 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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