Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms