Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBDO15205 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBDO15205 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms