Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PODXLO00592 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PODXLO00592 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PODXLO00592 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PODXLO00592 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PODXLO00592 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PODXLO00592 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PODXLO00592 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PODXLO00592 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PODXLO00592 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PODXLO00592 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PODXLO00592 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PODXLO00592 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PODXLO00592 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PODXLO00592 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms