Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP9YO00507 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP9YO00507 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP9YO00507 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP9YO00507 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP9YO00507 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP9YO00507 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP9YO00507 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP9YO00507 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9YO00507 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9YO00507 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms