Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf229H3BNL8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf229H3BNL8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms