Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms