Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms