Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms