Protein–RNA interactions for Protein: E2RYF7

HCG22, Protein PBMUCL2, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG22E2RYF7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HCG22E2RYF7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms