Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DSR2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DSR2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DSR2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DSR2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DSR2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DSR2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DSR2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DSR2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms