Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms