Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms