Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms