Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms