Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM223A0PJW6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms