Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms