Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF330Q9Y3S2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF330Q9Y3S2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF330Q9Y3S2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF330Q9Y3S2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF330Q9Y3S2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF330Q9Y3S2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF330Q9Y3S2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF330Q9Y3S2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF330Q9Y3S2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF330Q9Y3S2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF330Q9Y3S2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF330Q9Y3S2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF330Q9Y3S2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF330Q9Y3S2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF330Q9Y3S2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF330Q9Y3S2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF330Q9Y3S2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF330Q9Y3S2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms