Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms