Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NINLQ9Y2I6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms