Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms