Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPCN1Q9ULQ1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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