Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms