Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms