Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2IRD1Q9UHL9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms